黃肉的菠蘿蜜有淡黃，黃，深黃之分，紅肉菠蘿蜜顏色有淡紅，橘紅，深紅之分，這些顏色差異的形成受品種與熟度的影響，一般來說所有菠蘿蜜未熟的時候，果肉顏色都是白色/米白色的，其顏色隨著果實的熟度上升，慢慢變深。
對于紅肉菠蘿蜜其中的紅，不是指真正的顏色的紅，而是指靠近果核部分的果肉會呈現橘紅色，而黃肉則整個果肉都是偏黃色的，并且目前市面上所做的紅肉一般都是以淡紅與橘紅為主，很少全紅，深紅的，菠蘿蜜紅肉和黃肉比較一下顏色還是可以很明顯看出區別的。
紅肉的果形要偏圓潤，飽滿一點，果刺要疏松，大一點，果中等一般在5-15kg；黃色菠蘿蜜果形相對紅肉來說偏長形，且果刺密集且感觀上較尖，果大一般單果重在10-20kg。
紅肉菠蘿蜜由于果實比較圓潤飽滿，果肉較小塊，果絲相對較少，出肉率一般40-50%左右，一般13斤的果子出果率高達7斤；一般黃肉的果肉較大塊，但果絲較多，出肉率一般在30-40%左右，20斤的果子出果率在6斤左右。
紅肉菠蘿蜜果肉呈橙紅色，肉厚甜脆，香味比較濃郁，甜度高達25度左右；黃肉菠蘿蜜果肉呈金黃色，甜度比紅肉菠蘿蜜清淡，果肉甜度只有17度左右。
