12-13世紀乃是張仲景被圣化的開始階段，不過當時他的地位尚未定于一尊，與明清以后醫界王者地位仍有相當的距離。盡管如此，仲景在醫界的圣化格局已初步奠定。而在此后的數百年中，似乎少有人在名號上進一步尊崇他，直到16世紀中期，才又興起新一波的尊崇和圣化運動。
這新一波的運動肇端于李濂的《醫史》（刊行于1546年）。李濂在《醫史》中為張仲景立傳，稱張仲景為“醫中亞圣”。隨后，新安醫家徐春圃在成書于1556年的《古今醫統大全》中首次直接稱其為“醫圣”，其言：“張機，字仲景，南陽人，受業張伯祖，醫學超群，舉孝廉，官至長沙太守。……凡移治諸證如神，后人賴之為醫圣。”緊接著，多部醫書在敘述仲景時都出現了“后世稱為醫圣”的說法。
與此相伴隨的，則是仲景在醫界獨尊地位逐步確立。這時人們在評論仲景時，也不再局限于傷寒學，而是認為就整個醫界來說，他也具有無比崇高甚至獨尊的地位。
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